SSR检测 也称简单重复序列，是广泛分布在真核生物基因组中的简单重复序列。

• 中文名 SSR检测
• 外文名 SSR
• 别称 简单重复序列
• 存在于 真核生物基因组中的简单重复序列
• 英文名 simple sequence repeat

SSR检测简介

　　微卫星位点通常通过PCR扩增和电泳检测，并根据片段大小分离等位基因进行分析;扩增后的等位微卫星可以用多种方法检测，传两临农额些编液用统方法采用聚丙烯酰胺凝胶电泳加放射显影或银染的方法，费时费力效率低。阅微基因基于5年的经验，利用ABI遗传分析仪对荧光标记的DNA片段进行检测，结合分子量内标进行DNA片段长度计算，使STR分型变得高效快捷，结果也更加精确。

SSR检测

服务项目

　　1.SSR引物开发

　　通过富集微卫星序列，开发出20-30条具有一定重复特征的微卫星序列，并且对序列进行多态性和特异性验证。

　　2.引物筛选

　　选取部分代表性样本，利用普通引物进行PCR扩增，然后利用高分辨率芯片电泳或PAGE验证引物的特异性、扩增效率和基因座多态性等信息。

　　3.样本批量扩增

　　用带有荧光标记(FAM/HEX/TMR/ROX等)的引物，对批量来自样本进行PCR扩增。我公360百科司拥有高通量PCR仪平台轴目区全验，可以满足大量样本扩增需求。

　　4.测序仪检测

　　带有荧光标记的PCR产物进行稀释后与分子量内标混波田江斗门合，用3730xl等测序仪进行毛细管电泳，并得到原始数据。 5.原始数据分析

　　编制panel和bin等文件，使用正版GeneMapper v4.0软件分析测序仪得到的fsa文件，晶李担并生成PDF图谱和E较电谓无第销创才xcel文档(包括size、基因分型等信息)，分析后的电泳图谱。

　　6.群体遗传学分析

　　利用生物信息学软件(POPGENE、ME逐底材方杆弦米还更晚GA、PHYLIP、ARLEQUIN等)对上述数据进行进一步分析，绘制遗传连锁图谱、分析连锁不平衡和分析多态性等。

送样要求

　　细胞(≥10)、组织(≥300mg)、血液(六接粮杂能法真策国≥1ml)、基因组DNA车肉穿放资热学查界诗(≥20μl，浓度≥ 50ng/μl);引物信息、片段长度范围、琼脂糖电泳图等。

提供结果

　　引物、微卫星分析的原始数据以及GeneMapper生成的PDF图谱、包含片段长度等信法五钱何合看唱始进息的Excel文档和进一步的分析结果等。

成功案例

　　到目任线已茶酒械矿稳杀玉前为止，阅微基因与上百家科研机构建立合作，进行过多个物种的引物开发、多态性分析、种系鉴定和连锁图谱构建等工作，包括人、小鼠、大鼠、兔、马、犬、牛、大熊猫、鱼、虾、麻雀、蜜蜂、蚊子、蚜虫、瓢虫、小麦、玉米、大豆、棉花、杨树、苹果、葡萄和真菌等。