中级安全工程师证书不注册是不会过期作废的，中级安全工程师注册证书的有效期为5年，5年内没有进行初始注册的，需要进行继续教育才可以申请初始注册。申请初始注册时需要提交初始注册申请表、与聘用单位签订的从事安全生产管理或安全工程技术工作的劳动合同(复印件)或者聘用文件(复印件)或者聘用证明等申请材料。

中级注册安全工程师初始注册办法具体如下：

第一步：进入系统主页，选择注册渠道，点击‘初始注册’，进入注册渠道选择页面；

第二步：填写身份验证信息，选择注册机构；

第三步：填写申报表，填写聘用单位信息、工作经历等，上传其他资料扫描件或文件，点击‘提交’，完成注册申请；

第四步：点击“预览”可看到将要上报给各省级、部门注册机构及备案央企的初始注册申请表。预览无误后点击提交即可；

第五步：按照提示导出保存初始注册申请表进行打印，并与其他申请材料一并上交各省级、部门注册机构及备案央企；

第六步：审查；

第七步：证书打印、发放。