嫁接成活的内在因素主要是砧木和接穗的亲和力，也就是砧木和接穗在内部组织结构、遗传和生理特性上有某种相似性，通过嫁接能够相互结合在一起，互相不排斥进行正常生长的能力。亲和力主要取决于砧木和接穗的亲缘关系。一般亲缘关系越近，亲和力越强。同种的植物都可以相互嫁接。不同种但同属的植物有嫁接的可能性，不同科的植物可能性很小。