孔雀鱼可以看尾鳍、背鳍、腹鳍、腹部和体色来分公母，公鱼的尾鳍和背鳍很长，腹鳍较窄，腹部被白肚皮包着，体色艳丽，而母鱼的尾鳍、背鳍和腹鳍较短较宽，呈扇形，腹部可见内部颜色，体色单一。

1、尾鳍

通过尾鳍的大小可以分辨孔雀鱼的公母，公孔雀鱼的尾鳍特别长，像蝴蝶的翅膀，而母孔雀鱼的尾鳍要短上许多，呈小扇形。

2、背鳍

不单单是尾鳍，从背鳍的区别中也能分出孔雀鱼的公母。如尾鳍一样，公孔雀鱼的背鳍比较长，而母孔雀鱼的背鳍比较短，并且和尾鳍一样也呈扇形。

3、腹鳍

公孔雀鱼的腹鳍较窄，有些孔雀鱼的腹鳍则较长、较短，但母孔雀鱼的腹鳍较宽，如尾鳍、背鳍那般仍然呈现为扇形。

4、腹部

分辨孔雀鱼的公母还可以看它们的腹部，母鱼可见腹部内部的颜色，而公鱼的腹部被白肚皮包着，看不见里面的颜色，因此只有母鱼有胎斑。此外，公鱼身体更加艳丽，有漂亮的花纹，但母鱼体色比较单一，缺少绚丽的花纹。