新疆维吾尔自治区天山东部国有林管理局成立于2008年2月。成立后的国有林管理局为隶属于自治区林业厅管理的副厅级事业单位。管理原由自治区林业厅管理的乌鲁木齐南山林场、乌鲁木齐板房沟林场、哈密林场、木垒林场、奇台林场、吉木萨尔林场、米泉林场、呼图壁林场、玛纳斯南山林场、沙湾林场、乌苏林场等11个林场。