2013年4月经国家教育行政学院研究，决定成立“基础教育研究中心”。国家教育行政学院基础教育研究中心属学院内设非实体学术性机构，主要业务範围包括：开展基础教育问题研究、学术国家教育行政学院基础教育研究中心交流与对外合作，围绕基础教育问题开展相关培训、成果开发和政策谘询等。中心主任为教育行政教研部包金玲同志。
国家教育行政学院基础教育研究中心方向为：教育经济与管理、教师管理等。中心承担多个课题项目，并在《教育发展研究》、《教育与经济》、《比较教育研究》、《外国教育研究》、《基础教育研究》、《中国小管理》以及《中国教育报》等专业报刊上发表多篇论文。其中，不少论文被《新华文摘》、人大複印资料转载。
国家教育行政学院基础教育研究中心在开展基础教育专题研究的同时，还将围绕基础教育热点难点问题开展专题培训、典型案例开发和政策调研谘询等，致力于为一线教育工作者提供专业指导和服务，并积极为教育部等决策部门提供政策谘询建议。