为填补中国国内在医疗器械装置研究等生物医学工程产业领域的空白，回响国家《中长期科技发展规划纲要（2006-2020）》要求，2008年2月，中科院与江苏省、苏州市共建“中国科学院苏州生物医学工程技术研究所”。

2008年8月，中编办正式批覆成立中科院苏州医工所，中国科学院委託长春光学精密机械与物理研究所负责苏州医工所筹建工作；8月29日，中科院发文正式成立中科院苏州医工所；10月，长春光学精密机械与物理研究所与苏州高新区签订了《筹建备忘录》。

2009年6月，苏州医工所园区正式开工奠基。

2010年3月，院省市三方签订《二期建设协定书》，明确了一二期建设经费共7.8亿元，建设用地208亩。12月，所园区落成启用。

2012年11月，中国科学院苏州生物医学工程技术研究所正式通过验收委员会（由中科院、江苏省、苏州市及国家有关部委领导组成）验收。

截至2018年6月，苏州医工所人员总量679人。其中万人计画1人，江苏省双创人才22人；研究员50人，副研究员76人；博士生导师58人，硕士生导师44人，在学研究生196人；硕士及以上学历占96%，35岁及以下青年职工占85%。

中国工程院院士：周寿桓

中组部“万人计画”青年拔尖人才：史国华

截至2018年8月，苏州医工所设立了9个研究室（中心），建成中国科学院生物医学检验技术重点实验室、江苏省医用光学重点实验室和7个苏州市高技术研究重点实验室。

研究室（中心）：医用光学技术研究室、医学检验技术研究室、医学影像技术研究室、医用电子技术研究室、医用声学技术研究室、康复工程技术研究室、光学与健康研究中心、工程化研究中心、医疗健康信息中心

截至2018年8月，苏州医工所搭建了价值5000多万元的包括设计、加工、测试与检验等功能的工程化平台，组建了近百人的专业化工程技术队伍，在中国国内外多个地区建立了分支机构。

截至2016年10月，中国科学院苏州生物医学工程技术研究所公共技术服务中心由医用微纳技术支撑平台、医用精密机械技术支撑平台、生物医学检测平台、先进光学显微成像平台和所部实验室构成。医用微纳技术支撑平台建有百级、千级和万级洁净实验室，以及配套的光学平台和生物实验室，总面积400平方米，拥有MEMS前道和后道加工设备，主要开展纳米加工和表面微製作技术和工艺的研究，具备微光机电设计、加工的技术能力；同时该平台面还提供微感测器、微执行器以及相关MEMS器件的加工服务。医用精密机械技术支撑平台拥有超精密机械加工及检测设备，具备微米到亚微米的精密机械加工和装调能力、医用光学超精密加工能力，可进行医学精密仪器的设计、加工、检测与装调。生物医学检测平台具备开展血型检测试剂开发、蛋白纯化分析、单克隆抗体製备、化学分子合成及表征等相关测试分析能力。先进光学显微成像平台由苏州医工所自主研发的雷射扫描共聚焦显微镜、单分子定位超分辨显微镜、结构光照明超分辨萤光显微镜、基于雷射干涉的Trif-SIM和非线性SIM共四套超分辨显微成像设备组成，可用于生命科学领域各类观测实验。

截至2018年8月，苏州医工所累计授权专利近700项，其中发明专利200余项；发表高水平研究论文近1000篇。共承担国家、中科院及省市各类科技项目、军工项目、企业委託项目600余项，科研经费总额6.7亿元。

截至2018年8月，苏州医工所已成功孵化项目公司44家，注册资本5.3亿元，吸引社会投资2.5亿元；流式细胞仪和血栓弹力图仪等项目已顺利转移转化，深层光谱治疗仪拿到医疗器械产品注册证并转让给企业，高端显微镜——双光子显微镜以300万左右的价格销售到美国、德国、以色列等国；近两年，陆续获批江苏省产业技术研究院专业所和国家级专业化众创空间。

截至2018年9月，苏州医工所研究生招生学科有：学术学位一级学科硕士点3个、学术学位二级学科硕士点1个、专业学位授权领域2个。

学术学位一级学科硕士点：生物学、光学工程、生物医学工程

学术学位二级学科硕士点：机械电子工程

专业学位授权领域：机械工程、生物工程

截至2018年9月，苏州医工所有博士生导师32人，硕士生导师60人，另有外聘知名医院、高校等兼职博士生导师34人，在学研究生193人。

截至2018年6月，苏州医工所研究生共有4人获得中科院院长优秀奖，3人获得中科院朱李月华优秀博士生奖学金，7人赴国外高水平大学或科研机构进行研究工作或攻读博士学位。研究生住宿5人（或3人）一套间，每人拥有独立的卧室，配备卫生间、热水器、空调、网线和齐全的家具，并免收住宿费。入所后，硕士生待遇不低于2000元/月、博士生不低于3500元/月（含餐补），并为在所学生办理苏州市大学生医保及人身意外险。

苏州医工所已与美国约翰霍普金斯大学，塔夫斯大学，德国慕尼黑工大等高校建立了全面的战略合作关係，通过项目合作、人员交流培训、共建研发中心和联合实验室等多种方式，吸国际先进技术和高端人才。成果转化模式走向世界，并已在硅谷设立成果转化海外中心。

苏州医工所所标由五个绿色模组与两条蓝色弧形构成。

标誌中的绿色模组，构成英文字母S，标明本所所在地（苏州），同时代表着本所的主要学科领域，寓意着科技创新无限、发展前景广阔。

标誌中的蓝色双弧线，表明苏州医工所为院地共建机构的特徵，同时寓意本所科学研究与产业化相互促进、协调发展。

绿色模组与蓝色弧线构成汉字“中”，表明本所为国立科研机构的特徵。同时，双弧线为长春光机所所标外环的变形，表示苏州医工所依託长春光机所筹建和管理运行。

整个标誌动中蕴静、静中蕴动，表明本所放眼国际前沿、牢筑基础，立足国内需求、服务百姓的发展理念，体现了本所“创新生物医学工程，服务人民健康幸福”的建所宗旨。

标誌整体设计稳重大气、寓意丰富、视觉冲击力强。

发展理念：忠诚 务实 合作 创新

定位：面向生物医学的重大需求，开展先进生物医学仪器、试剂和生物材料等方面的基础性、战略性、前瞻性的研究工作，引领生物医学工程技术的发展，建成医疗仪器科技创新与成果转化平台，成为不可替代的国立研究机构